Create a data frame that can be fed to the upset function
create_upsetdata(res_enrich, use_ids = FALSE)A data.frame object, storing the result of the functional
enrichment analysis. See more in the main function, GeneTonic(), to see the
formatting requirements.
Logical - whether to use the gs_identifiers as names, or the
values provided as gs_description. Defaults to FALSE, using the full
descriptions
A data.frame to be used in ComplexUpset::upset()
# res_enrich object
data(res_enrich_macrophage, package = "GeneTonic")
res_enrich <- shake_topGOtableResult(topgoDE_macrophage_IFNg_vs_naive)
#> Found 500 gene sets in `topGOtableResult` object.
#> Converting for usage in GeneTonic...
create_upsetdata(res_enrich[1:20, ])
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